随着微生物研究的进步，及医务营养工作者的努力 ，益生菌对人类的健康被越来越多的人认知。从出生那一刻起益生菌便跟着我们，开始了与人共生互利的生命旅程，谁也离不开谁。
正常菌群存在于我们的皮肤、口腔、胃部和肠道中，发挥着各自的作用，但是真正被称作益生菌的菌群，目前被视为能够耐受胃酸，成功定殖于肠道中，并能够维持肠道微生态平衡的菌群。
目前研究表明益生菌可以维持胃肠道健康、增强免疫力、促进营养吸收、合成营养素、降低抗生素的副作用等等。
新生儿可以从母体的产道中、初乳中得到益生菌，并开始在肠道中定殖，也是宝宝肠道微生态环境建立的开始，定殖情况关乎到宝宝后期的肠道健康。
比如酸奶、奶酪、醋、豆制品、腌制食品（泡菜）、酒等等。这是我们日常饮食生活中，最为常见的获得益生菌的途径，通常参与的益生菌有酵母菌、各类乳酸菌等。
一些特殊人群及需要用益生菌预防或缓解某些健康问题时，可直接服用益生菌制剂。比如：
（1）剖腹产的宝宝不能直接从妈妈产道中获取益生菌可以出生时补充；
（2）完全奶粉喂养的宝宝不能从初乳中获取益生菌，出生后也可以适当补充；
（3）腹泻便秘期间服用益生菌可以得到缓解；
（4）免疫力不佳和过敏体质的人群服用益生菌可以调节免疫力，改善体质。
益生菌对胃酸很敏感，正常胃酸PH值为1.8左右，这样的环境不利于益生菌的存活。因此需要找到胃酸低，即PH值相对较高的时机服用益生菌。
传统认为婴幼儿空腹时的胃酸PH值为4.5，但是据国内外研究发现，新生儿（28天内）空腹胃酸PH值为2.3左右，1岁以后PH值为1.9左右，已经接近成人水平，空腹时由于饥饿和受到食物诱导时，中枢神经会“指挥”胃部分泌更多的胃酸，这样的环境显然是不适合益生菌生存的。
此外，早上刚起床时分泌的胃酸较少，但是能否达到适合益生菌生存的PH值，还没有找到理论依据，尚有争论，因此不建议早上空腹食用益生菌。
进食后食物对胃壁的刺激，中枢神经进一步指导胃酸分泌增多，在胃部消化的初期，胃酸分泌逐渐达到高峰，因此在吃饭时补充效果也不太好，但比起空腹来说好得多；
在餐后半小时-1小时后，达到了饱腹感，胃酸的分泌有所减少，加之此时食物还在胃中，可以中和胃酸，PH值有所升高，大大减少了对益生菌的破坏，这期间摄入益生菌是比较适合的。
益生菌大多是不耐高温的，温度超过40摄氏度时活性便会降低并不可逆。为了保证益生菌的活性，当室内温度高于20摄氏度时，建议可以放冰箱冷藏保存。有些袋装粉剂的益生菌，开封后如果没有吃完，应该立即封口放冰箱或者丢弃，以免有害菌入侵，影响效果。
其实水温不能超过37℃最好，避免高温杀死益生菌。如果婴幼儿不爱吃，想加在奶粉里服用，不能先放益生菌，因为冲调奶粉的水温一般都高于40摄氏度，可以将奶粉冲调好后，温度低至37度时（手腕滴奶液温热无汤感），再加入益生菌。发酵制品中的酸奶、奶酪最好不要加热吃，注意这类奶制品宝宝1岁以后才可少量摄入。
抗生素在杀死有害菌的同时也会杀死益生菌，服用了抗生素后2-3小时再吃益生菌较合适。服用了抗生素后，补充益生菌可以降低抗生素对身体产生的副作用，比如因抗生素出现的肠炎性腹泻。
大便次数一天超过五次、病毒或细菌感染引起的较为严重的腹泻，为了缩短病程，可以先选OTC的，专一性强，剂量高，能够较快补充腹泻时消耗的益生菌，腹泻恢复后可换成营养性的进行巩固和预防。当然，一般的消化异常、调节免疫力可首选营养性的益生菌。
益生菌种类繁多，每种益生菌的作用都有其特殊性，很多作用都还需要进一步去研究去发现，但是目前也取得了一些客观的收获，比如一些益生菌在肠道中定殖位置，特殊作用等。举几个例子：
调理便秘：尽量选择含有双歧杆菌的益生菌，双歧杆菌可以到达大肠并定殖，促进肠蠕动，帮助排便效果更好。
缓解过敏：可选择含有罗伊氏乳杆菌、鼠李糖乳杆菌的益生菌，这两种菌在改善过敏性体质方面效果更佳。
减轻乳糖不耐受：可以选择含有嗜热链球菌的益生菌，这种菌可以直接分泌乳糖酶，且定殖于小肠的上半部分，对缓解乳糖不耐受有更积极的效果。
注意：嗜热链球菌不适合1岁以内的宝宝。
（选不对可能腹泻加重噢）
有的益生菌粉剂的辅料中含脱脂乳粉、全脂奶粉、乳糖等。奶粉过敏的宝宝，在腹泻期间避开含有脱脂乳粉、全脂奶粉的益生菌；乳糖不耐受的宝宝可避开含有乳糖的。
就目前研究结果看来，益生菌对人类健康生存、对亚健康体质的调节表现出了不错的效果，但是绝不能盲目将其看作治病防病的唯一良“药”，合理正确地利用益生菌才能保证身体的健康。
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